RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414499.1

C2orf54-204, Transcript of Uncharacterized protein C2orf54, human

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene C2orf54, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C2orf54-204	ENST00000414499	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PROX1	Q92786	737 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	TMEM160	Q9NX00	188 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.45	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	UBD	O15205	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	NPIPB7	O75200	414 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	P2RY4	P51582	365 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	BNIP2	Q12982	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FADD	Q13158	208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MIER2	Q8N344	545 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.44	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	GPRIN2	O60269	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PDE5A	O76074	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	CRYAA	P02489	173 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FAM157C	P0CG43	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	HTRA1	Q92743	480 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	NDUFS8	O00217	210 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	KLF11	O14901	512 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	LGI1	O95970	557 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PNMT	P11086	282 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	BMP2	P12643	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PRG2	P13727	222 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SELENOP	P49908	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PDLIM4	P50479	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	STX1B	P61266	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	RGN	Q15493	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	OR2T1	O43869	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	FZD7	O75084	574 aa		13.41	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	ETS2	P15036	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
C2orf54-204	ENST00000414499	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26

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