RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373115.4

CHST3-201, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST3, Length 6,970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3-201ENST00000373115 ESCO2Q56NI9 601 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 SKA3Q8IX90 412 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 CHRNB4P30926 498 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 RUNX2Q13950 521 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 NOX4Q9NPH5 578 aa14.52□□□□□ -0.08
CHST3-201ENST00000373115 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF217O75362 1048 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ADIRFQ15847 76 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FRMD1Q8N878 549 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CASD1Q96PB1 797 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CENPOQ9BU64 300 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 POFUT1Q9H488 388 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RNF212BA8MTL3 300 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EMP3P54852 163 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 AVPI1Q5T686 147 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC36A2Q495M3 483 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 LRFN5Q96NI6 719 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GNB4Q9HAV0 340 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EMCNQ9ULC0 261 aa14.52□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NUDT1P36639 197 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NT5DC2Q9H857 520 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR6C76A6NM76 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF91Q05481 1191 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 HTR4Q13639 388 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 BATF2Q8N1L9 274 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 C20orf202A1L168 122 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZFP92A6NM28 416 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TACR3P29371 465 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR1D4P47884 311 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TSSK2Q96PF2 358 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GAB2Q9UQC2 676 aa14.51□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC10A3P09131 477 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 HNF1AP20823 631 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 MMP12P39900 470 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ARL16Q0P5N6 197 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NTMT1Q9BV86 223 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CSO75390 466 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CEBPBP17676 345 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PRPH2P23942 346 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SUOXP51687 545 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GPLD1P80108 840 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PRSS38A1L453 326 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CTSCP53634 463 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ACSM1Q08AH1 577 aa14.5□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GPR176Q14439 515 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms