RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 THAP6Q8TBB0 222 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 NR4A3Q92570 626 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SMIM19Q96E16 107 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 MCHR1Q99705 422 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 GAREM1Q9H706 876 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 POT1Q9NUX5 634 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 IFITM5A6NNB3 132 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ACOT7O00154 380 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 BHLHE40O14503 412 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 WASP42768 502 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 AVPI1Q5T686 147 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 LHX9Q9NQ69 397 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 GLOD5A6NK44 160 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SULT1B1O43704 296 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SNAPINO95295 136 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PCCBP05166 539 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CDK2P24941 298 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PSMB5P28074 263 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TEAD1P28347 426 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 BDKRB2P30411 391 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PPP2CBP62714 309 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PPP2CAP67775 309 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CDK5R1Q15078 307 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TMEM240Q5SV17 173 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 AMER3Q8N944 861 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 NOX4Q9NPH5 578 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 UNC119BA6NIH7 251 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 UQCC3Q6UW78 93 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 LGR4Q9BXB1 951 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CERS4Q9HA82 394 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TAC3Q9UHF0 121 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.44■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 FEZF1A0PJY2 475 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 GNB5O14775 395 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A12O75746 678 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SMIM6P0DI80 62 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 GAB4Q2WGN9 574 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 MS4A8Q9BY19 250 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 MFRPQ9BY79 579 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SULT1C2O00338 296 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PTGFRP43088 359 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TSC22D1Q15714 1073 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM129CQ86XR2 697 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 OR2L2Q8NH16 312 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TCEAL3Q969E4 200 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PELI1Q96FA3 418 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM117AQ9C073 453 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 NIT2Q9NQR4 276 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 A0A0C4DFX4 3053 aa15.43■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ACOD1A6NK06 481 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 BMP7P18075 431 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SRMP19623 302 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 AGERQ15109 404 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 MPPED2Q15777 294 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
GDE1-201ENST00000353258 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms