RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.4■□□□□ 0.06
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PACS1-201ENST00000320580 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.4■□□□□ 0.06
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PACS1-201ENST00000320580 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 KDM8Q8N371 416 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR1S1Q8NH92 325 aa15.38■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 TEAD3Q99594 435 aa15.38■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.38■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.38■□□□□ 0.05
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PACS1-201ENST00000320580 COCHO43405 550 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 RENP00797 406 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 IGLV3-25P01717 112 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ALDH3B1P43353 468 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 SPINT3P49223 89 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF480Q8WV37 535 aa15.38■□□□□ 0.05
PACS1-201ENST00000320580 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.38■□□□□ 0.05
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