RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	DLX5	P56178	289 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	LGR4	Q9BXB1	951 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	C5orf42	Q9H799	3197 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	PEX12	O00623	359 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	ITGB8	P26012	769 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	PTP4A3	O75365	173 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	MPG	P29372	298 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	MESP2	Q0VG99	397 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	GRHL3	Q8TE85	626 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	SLC25A28	Q96A46	364 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	CMTM3	Q96MX0	182 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF98	A6NK75	572 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501		F5H5P2	479 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	LAT	O43561	262 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PLAUR	Q03405	335 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF613	Q6PF04	617 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PBX4	Q9BYU1	374 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CDH23	Q9H251	3354 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	LRG1	P02750	347 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TAS2R20	P59543	309 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SORD	Q00796	357 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR4K13	Q8NH42	304 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SNX33	Q8WV41	574 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF559	Q9BR84	538 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	KLF15	Q9UIH9	416 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	VEGFD	O43915	354 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ACHE	P22303	614 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NTHL1	P78549	312 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	FHL1	Q13642	323 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PXT1	Q8NFP0	134 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	VWCE	Q96DN2	955 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SDF2	Q99470	211 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	GPR174	Q9BXC1	333 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PRR32	B1ATL7	298 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF879	B4DU55	563 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ABCD4	O14678	606 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	EGF	P01133	1207 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RLN1	P04808	185 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CEBPE	Q15744	281 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	EID2	Q8N6I1	236 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OTUB2	Q96DC9	234 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CCL16	O15467	120 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NGFR	P08138	427 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	GRPR	P30550	384 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	DUSP8	Q13202	625 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	METRNL	Q641Q3	311 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	SYS1	Q8N2H4	156 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR2L5	Q8NG80	312 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	HAVCR1	Q96D42	359 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MFF	Q9GZY8	342 aa		18.81	■□□□□ 0.6

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