RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF563	Q8TA94	476 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	NOX3	Q9HBY0	568 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MPZL1	O95297	269 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT17	P0C025	328 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00032	P0C843	101 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FUT5	Q11128	374 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SCGB2A2	Q13296	93 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RDH5	Q92781	318 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SYNGR3	O43761	229 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS23	O95084	383 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	BCL10	O95999	233 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	UROS	P10746	265 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ACHE	P22303	614 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	NR4A1	P22736	598 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	TACR3	P29371	465 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM33	P57088	247 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	HBA1	P69905	142 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	DAG1	Q14118	895 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	MDP1	Q86V88	176 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	MTERF3	Q96E29	417 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SLC28A1	O00337	649 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	STX11	O75558	287 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	NAT2	P11245	290 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	MATN1	P21941	496 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	PRTN3	P24158	256 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEB1	P43366	347 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	MVK	Q03426	396 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZP4	Q12836	540 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	NPRL3	Q12980	569 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	PTGR1	Q14914	329 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	OR7A5	Q15622	319 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		10.38	□□□□□ -0.75
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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