RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 FAM122BQ7Z309 247 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CDK20Q8IZL9 346 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 LNX2Q8N448 690 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SETD9Q8NE22 299 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PTP4A1Q93096 173 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RELTQ969Z4 430 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NANSQ9NR45 359 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 AKAP13Q12802 2813 aa8.48□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR2M5A3KFT3 312 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 LIPT2A6NK58 231 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TAF4O00268 1085 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PLPP3O14495 311 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IMPA2O14732 288 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ENTPD6O75354 484 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 NDUFB2O95178 105 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RCBTB2O95199 551 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TNFAIP8O95379 198 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PPP1R3DO95685 299 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OPN1LWP04000 364 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PDGFAP04085 211 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ADRB1P08588 477 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CELA3AP09093 270 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CCDC159P0C7I6 412 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF17P17021 662 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 KLK2P20151 261 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GRPRP30550 384 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GRK5P34947 590 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MASP1P48740 699 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TNFSF10P50591 281 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MAP2K6P52564 334 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MLLT10P55197 1068 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 CDC42P60953 191 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MVKQ03426 396 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SNAPC1Q16533 368 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 SLC43A2Q8N370 569 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR2T33Q8NG76 320 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM163Q8TC26 289 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GGHQ92820 318 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 AMBNQ9NP70 447 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 FANCFQ9NPI8 374 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 ABI3Q9P2A4 366 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.47□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.46□□□□□ -1.05
SEC22C-216ENST00000493107 H0YC42 278 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 H3BML4 177 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 K7EM74 188 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 M0R082 166 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 ARPC3O15145 178 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 WISP2O76076 250 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 TXNDC12O95881 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 MT-ATP6P00846 226 aa8.46□□□□□ -1.06
SEC22C-216ENST00000493107 HPNP05981 417 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms