RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 VRK2Q86Y07 508 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SVOPLQ8N434 492 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM76AQ8TAV0 307 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NR4A3Q92570 626 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB1CQ92928 201 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 STMN2Q93045 179 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMG2Q969U7 264 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OXGR1Q96P68 337 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 GAL3ST1Q99999 423 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CLN8Q9UBY8 286 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 GOSR2O14653 212 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 YKT6O15498 198 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HUS1O60921 280 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3BGRLO75368 114 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 GPX5O75715 221 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ANOS1P23352 680 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OXTRP30559 389 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 DDOSTP39656 456 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGDSP41222 190 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NSG1P42857 185 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGCS2P54868 508 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 XIAPP98170 497 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC10A1Q14973 349 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 STK38Q15208 465 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP69Q49AA0 526 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 XKR4Q5GH76 650 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 REEP3Q6NUK4 255 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRTM1Q86UE6 522 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC49Q8IUZ0 686 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR56B4Q8NH76 319 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TOP1MTQ969P6 601 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ASB9Q96DX5 294 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC126Q96EE4 140 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC22AQ96IW7 307 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5SQ99766 215 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC29A1Q99808 456 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ATF6BQ99941 703 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GTH9 108 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GUH1 482 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GWB2 263 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF487B1APH4 448 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRPB1O00241 398 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC17A2O00624 439 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 IDH3BO43837 385 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT1A9O60656 530 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV1-44P01699 117 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINE2P07093 398 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKACBP22694 351 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CALCRP30988 508 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2G6Q5TZ20 316 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 REG3GQ6UW15 175 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TCAIMQ8N3R3 496 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF614Q8N883 585 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MSANTD3Q96H12 275 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51M1Q9H341 326 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINE3A8MV23 424 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ERQ8 282 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMD11O00231 422 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NMT2O60551 498 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CABYRO75952 493 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CLTAP09496 248 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NPR2P20594 1047 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 BCKDHBP21953 392 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms