RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 OR7A5Q15622 319 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GTDC1Q4AE62 458 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AGKQ53H12 422 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 REEP3Q6NUK4 255 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CASP12Q6UXS9 341 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AAED1Q7RTV5 226 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HDXQ7Z353 690 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 KRT73Q86Y46 540 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CADM2Q8N3J6 435 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM99Q8N816 258 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BBS10Q8TAM1 723 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 STON2Q8WXE9 905 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM45BQ96B21 275 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C3orf49Q96BT1 292 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BOD1Q96IK1 185 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SMR3AQ99954 134 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ALG2Q9H553 416 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C12orf10Q9HB07 376 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RASD1Q9Y272 281 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SHISA9B4DS77 424 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ABCD4O14678 606 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR2T1O43869 369 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINB7O75635 380 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RAD51DO75771 328 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CD8AP01732 235 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SOD3P08294 240 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ITGA5P08648 1049 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NUDT7P0C024 238 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ARAFP10398 606 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PNMTP11086 282 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRG2P13727 222 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A2P23975 617 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CD40P25942 277 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRPS1P60891 318 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CDK6Q00534 326 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BNIP2Q12982 314 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SQLEQ14534 574 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PGGHGQ32M88 737 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TTMPQ5BVD1 217 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AGAP6Q5VW22 663 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINA11Q86U17 422 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DTX2Q86UW9 622 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 WDR31Q8NA23 367 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR52N5Q8NH56 324 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TSPEARQ8WU66 669 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NEUROG1Q92886 237 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MAL2Q969L2 176 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEB18Q96M61 343 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF607Q96SK3 696 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 EBF4Q9BQW3 602 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.4□□□□□ -1.38
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