RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 VITQ6UXI7 678 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 MCHR2Q969V1 340 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TMEM18Q96B42 140 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ASB9Q96DX5 294 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 GPR21Q99679 349 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 POMPQ9Y244 141 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.37□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 MBD5Q9P267 1494 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 KLK8O60259 260 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF254O75437 659 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CREG1O75629 220 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF286BP0CG31 522 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 HSD11B1P28845 292 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 AQP1P29972 269 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 C1QTNF8P60827 252 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ACTC1P68032 377 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ACTA1P68133 377 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 PLP2Q04941 152 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 NPTX1Q15818 432 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR2A2Q6IF42 318 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 GID4Q8IVV7 300 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 FTMTQ8N4E7 242 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR7G2Q8NG99 324 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR2T29Q8NH02 315 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TM9SF4Q92544 642 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 GLYATL1Q969I3 302 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TMEM45BQ96B21 275 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 SDSLQ96GA7 329 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 BTF3L4Q96K17 158 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LGMNQ99538 433 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 E7EQ34 232 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 INSIG1O15503 277 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 XPNPEP2O43895 674 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 SCO1O75880 301 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 MT-CO2P00403 227 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 DPEP1P16444 411 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CCNOP22674 350 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 GABRR2P28476 465 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 SLC11A1P49279 550 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 DSTNP60981 165 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF33AQ06730 810 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 FOXL1Q12952 345 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LGI4Q8N135 537 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OR10A6Q8NH74 314 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 TMEM234Q8WY98 164 aa3.36□□□□□ -1.87
LATS1-201ENST00000253339 OSTF1Q92882 214 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms