RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.68■□□□□ 0.9
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOMM70O94826 608 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERPINB2P05120 415 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SUCLG2Q96I99 432 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 H7C1W4 665 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 APBB1O00213 710 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGL2O15211 777 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 SKAP1Q86WV1 359 aa20.64■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF181Q9P0P0 153 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARP10Q53GL7 1025 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 APLP1P51693 650 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 AOX1Q06278 1338 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C8orf34Q49A92 452 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 BCL11AQ9H165 835 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-210ENST00000617904 H0YIN7 160 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 MX1P20591 662 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP10Q86W26 655 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPRSQ9NQ92 184 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC22Q5TAA0 569 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.55■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXO3Q9UK99 471 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAMTA2O94983 1202 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC45O75419 566 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMNB1P20700 586 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPTP24298 496 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE1AP54750 535 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 HLFQ16534 295 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFFO2Q5TF58 517 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-210ENST00000617904 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 NFKBIEO00221 500 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 STAP2Q9UGK3 403 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE8AO60658 829 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE6BP35913 854 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 FSTL1Q12841 308 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXO4P98177 505 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETDB2Q96T68 719 aa20.51■□□□□ 0.87
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