RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-218ENST00000557695 GPLD1P80108 840 aa10.12□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.12□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 SEC13P55735 322 aa10.11□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.11□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 WWC1Q8IX03 1113 aa10.1□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 ALX3O95076 343 aa10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 RASA1P20936 1047 aa10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HECTD1-218ENST00000557695 SASH3O75995 380 aa10.08□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 IGFBP4P22692 258 aa10.08□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.08□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 FSTP19883 344 aa10.07□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 PCSK7Q16549 785 aa10.07□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 BTBD11A6QL63 1104 aa10.06□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 PTK7Q13308 1070 aa10.06□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 DGKZQ13574 1117 aa10.06□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 Q6ZS46 218 aa10.06□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 USP20Q9Y2K6 914 aa10.06□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 F8W735 103 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 OPLAHO14841 1288 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 MED26O95402 600 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 RARAP10276 462 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 EPB42P16452 691 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 CD97P48960 835 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 ARSDP51689 593 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.05□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 RAD21O60216 631 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 MICAL2O94851 1124 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 NRLP54845 237 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 DPYDQ12882 1025 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.04□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 SSTR4P31391 388 aa10.03□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 HINFPQ9BQA5 517 aa10.03□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HECTD1-218ENST00000557695 EGFRP00533 1210 aa10.02□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.02□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 J3QW42 95 aa10.01□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 SETDB1Q15047 1291 aa10.01□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 ARXQ96QS3 562 aa10.01□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.01□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 WEE1P30291 646 aa10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10□□□□□ -0.814e-7■□□□□ 8.3
HECTD1-218ENST00000557695 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 GLMNQ92990 594 aa10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 PLD4Q96BZ4 506 aa10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 MYO19Q96H55 970 aa10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.99□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.99□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L15C9J2P7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L10C9JJH3 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L12C9JPN9 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L11C9JVI0 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L21D6R901 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L18D6R9N7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L22D6RA61 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L19D6RCP7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L20D6RJB6 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 TM4SF5O14894 197 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 USP17L24Q0WX57 530 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 SLC51AQ86UW1 340 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.98□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 MMP20O60882 483 aa9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 ADAMTS4O75173 837 aa9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 SIK1P57059 783 aa9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HECTD1-218ENST00000557695 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.96□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.96□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 FAM196BA6NMK8 535 aa9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 XYLBO75191 536 aa9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 TGFB1P01137 390 aa9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 FOXO3O43524 673 aa9.94□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 WISP1O95388 367 aa9.94□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 FLIIQ13045 1269 aa9.94□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.94□□□□□ -0.82
HECTD1-218ENST00000557695 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms