RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 TMC4Q7Z404 712 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 CNTROBQ8N137 903 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 MPNDQ8N594 471 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 GOLGA2Q08379 1002 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF428Q96B54 188 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 EPS15P42566 896 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 FAM89AQ96GI7 184 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-208ENST00000493601 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 CXCL9Q07325 125 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 VEGFBP49765 207 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-208ENST00000493601 TNIP1Q15025 636 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 TNS4Q8IZW8 715 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-208ENST00000493601 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 COL4A1P02462 1669 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRU-208ENST00000493601 MYD88Q99836 296 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRU-208ENST00000493601 WASHC4Q2M389 1173 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 AIDAQ96BJ3 306 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 YDJCA8MPS7 323 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRU-208ENST00000493601 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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PTPRU-208ENST00000493601 FOXN1O15353 648 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 TSPYL6Q8N831 410 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-208ENST00000493601 POLLQ9UGP5 575 aa21.4■■□□□ 1.02
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PTPRU-208ENST00000493601 CCDC184Q52MB2 194 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 STK31Q9BXU1 1019 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 H7C1D1 291 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 RIMBP2O15034 1052 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 PDE8AO60658 829 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 ECE2O60344 883 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 CST9Q5W186 159 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 MICALL2Q8IY33 904 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 WBP1LQ9NX94 342 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 IL16Q14005 1332 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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PTPRU-208ENST00000493601 ECE1P42892 770 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 KSR2Q6VAB6 950 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-208ENST00000493601 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.36■■□□□ 1.01
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