RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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CLTB-202ENST00000345807 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 TAF1P21675 1872 aa29.41■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.4■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 EPS15P42566 896 aa29.4■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 GOLGA2Q08379 1002 aa29.4■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 TMC4Q7Z404 712 aa29.4■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.4■■■□□ 2.3
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CLTB-202ENST00000345807 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.4■■■□□ 2.3
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CLTB-202ENST00000345807 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.39■■■□□ 2.3
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CLTB-202ENST00000345807 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.38■■■□□ 2.29
CLTB-202ENST00000345807 CCDC184Q52MB2 194 aa29.38■■■□□ 2.29
CLTB-202ENST00000345807 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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CLTB-202ENST00000345807 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.34■■■□□ 2.29
CLTB-202ENST00000345807 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.34■■■□□ 2.29
CLTB-202ENST00000345807 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.33■■■□□ 2.29
CLTB-202ENST00000345807 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
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CLTB-202ENST00000345807 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.32■■■□□ 2.28
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CLTB-202ENST00000345807 VEGFBP49765 207 aa29.3■■■□□ 2.28
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CLTB-202ENST00000345807 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.29■■■□□ 2.28
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CLTB-202ENST00000345807 RASSF10A6NK89 507 aa29.27■■■□□ 2.28
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CLTB-202ENST00000345807 WASHC4Q2M389 1173 aa29.27■■■□□ 2.28
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CLTB-202ENST00000345807 EYA3Q99504 573 aa29.22■■■□□ 2.27
CLTB-202ENST00000345807 STK31Q9BXU1 1019 aa29.22■■■□□ 2.27
CLTB-202ENST00000345807 MRS2Q9HD23 443 aa29.22■■■□□ 2.27
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CLTB-202ENST00000345807 IL16Q14005 1332 aa29.2■■■□□ 2.26
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CLTB-202ENST00000345807 ECE2O60344 883 aa29.17■■■□□ 2.26
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