RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	WASF3	Q9UPY6	502 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CMAHP	Q9Y471	501 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GW55	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRIT2	A6NDA9	550 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FXYD1	O00168	92 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX12	O00623	359 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EFS	O43281	561 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10H2	O60403	315 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNB3	Q05901	458 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MPEG1	Q2M385	716 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM107	Q6UX40	140 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM64	Q6YI46	380 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR151	Q8TDV0	419 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC46	Q96FV0	321 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MED11	Q9P086	117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX4	Q9UBX2	424 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TCFL5	Q9UL49	500 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		G3V3Y1	287 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AZIN1	O14977	448 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD28	O15084	1053 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXS1	O43638	330 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GALT2	O43825	422 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0513	O60268	411 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GPX5	O75715	221 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FPR3	P25089	353 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53BP2	Q13625	1128 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS6KA2	Q15349	733 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KANK2	Q63ZY3	851 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG9B	Q674R7	924 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NR4A3	Q92570	626 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC58	Q96CX6	371 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBC2	A0A5B9	178 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	URAD	A6NGE7	173 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		B4E171	279 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2C	O00762	179 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN4	O14493	209 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLPP1	O14494	284 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STOM	P27105	288 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R50	P59544	299 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PTGR1	Q14914	329 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC23B	Q15437	767 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NKG7	Q16617	165 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	THEM4	Q5T1C6	240 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AVPI1	Q5T686	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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