RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 OR10A4Q9H209 315 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 C12orf10Q9HB07 376 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 KLHL28Q9NXS3 571 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CCDC22O60826 627 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NPIPB7O75200 414 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PPP3CBP16298 524 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 IDUAP35475 653 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 OR3A2P47893 321 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SEC24CP53992 1094 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 RABL3Q5HYI8 236 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 STK35Q8TDR2 534 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 TRIM2Q9C040 744 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GID8Q9NWU2 228 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 LIPT2A6NK58 231 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 M0QX08 132 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 FAM107AO95990 144 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 HRGP04196 525 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GPIP06744 558 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 FPR1P21462 350 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 HTR2AP28223 471 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 BNIP2Q12982 314 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SPATA21Q7Z572 469 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CDC20BQ86Y33 519 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CCDC103Q8IW40 242 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GPR171O14626 319 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 C8BP07358 591 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CRYGSP22914 178 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 VMACQ2NL98 169 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ECSITQ9BQ95 431 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 HDHD5Q9BXW7 423 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 A0A1B0GWA3 101 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 RAMP1O60894 148 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CEACAM7Q14002 265 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 P2RY6Q15077 328 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 DUSP7Q16829 419 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZT83 130 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CCDC80Q76M96 950 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SMYD1Q8NB12 490 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FAM107BQ9H098 131 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 LGI1O95970 557 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NCALDP61601 193 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 OR7A5Q15622 319 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ELOA3Q8NG57 546 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 RCN3Q96D15 328 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ENO4A6NNW6 628 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TPST2O60704 377 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 OPN1SWP03999 348 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PNMTP11086 282 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 EGR4Q05215 589 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 VEZF1Q14119 521 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SLC17A1Q14916 467 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SFRP5Q5T4F7 317 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ULK3Q6PHR2 472 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 STEAP2Q8NFT2 490 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TAMM41Q96BW9 452 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ZNF583Q96ND8 569 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ARHGDIGQ99819 225 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PIF1Q9H611 641 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 AQP7P3A6NL99 342 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SIAH2O43255 324 aa22.04■■□□□ 1.12
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