RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882		M0R129	80 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYC1	P08574	325 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FADD	Q13158	208 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	DIO2	Q92813	273 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NME2P1	O60361	137 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GUCY1B2	O75343	617 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NME2	P22392	152 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRK5	P34947	590 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR1E2	P47887	323 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	VEZF1	Q14119	521 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58	2e-6	■■■■■ 33
RABGEF1-209	ENST00000607882	EPYC	Q99645	322 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZG16	O60844	167 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	UPK1B	O75841	260 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPC1	P35052	558 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGEA5	P43359	124 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASMT	P46597	345 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	EMD	P50402	254 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RGN	Q15493	299 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	BLACE	A4D250	179 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP1B1	P05026	303 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABCD3	P28288	659 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRAT	P43155	626 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TDGF1P3	P51864	188 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FUT7	Q11130	342 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	POC5	Q8NA72	575 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF32	Q9H0A6	362 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1B0GTH9	108 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GNB5	O14775	395 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	STS	P08842	583 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GGT2	P36268	569 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDH12	P55289	794 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	C3AR1	Q16581	482 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	GGH	Q92820	318 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RABGEF1-209	ENST00000607882	COQ7	Q99807	217 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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