RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCR2P25025 360 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SGCAQ16586 387 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RDH10Q8IZV5 341 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5B2Q96R09 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMK2N2Q96S95 79 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD84Q9UIB8 345 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRAS1Q86XX4 4008 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NFASCO94856 1347 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL7A1Q02388 2944 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR56A5P0C7T3 313 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POU2F1P14859 743 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GLP1RP43220 463 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEA4P43358 317 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP6AP1Q15904 470 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIGITQ495A1 244 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAQR9Q6ZVX9 377 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SFRP1Q8N474 314 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC01560Q8TB33 94 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP36Q96G28 342 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPV6Q9H1D0 765 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10A4Q9H209 315 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00597Q9H2U6 94 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRMSQ9H3Y6 488 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CR1P17927 2039 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THADAQ6YHU6 1953 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDHAF1A6NFY7 115 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NME2P1O60361 137 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOBTB1O94844 696 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHDP01880 384 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPS2P11908 318 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNR1P21554 472 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCKP27707 260 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCL11P51671 97 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRT83P78385 493 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCZ1BP86790 482 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BDH1Q02338 343 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCN1BQ07699 218 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASPHQ12797 758 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAGE3Q14657 143 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf141Q5JVX7 400 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC30A6Q6NXT4 461 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TUSC5Q8IXB3 177 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM105Q8N8V8 129 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXL13Q8NEE6 735 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR56B4Q8NH76 319 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELMO2Q96JJ3 720 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF382Q96SR6 550 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ECSITQ9BQ95 431 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM246Q9BRR3 403 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF385DQ9H6B1 395 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTPS2Q9NRF8 586 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MUI8 341 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C4orf51C9J302 202 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNA14O95837 355 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPP4P27487 766 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTCP35070 178 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OPRD1P41143 372 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAMPTP43490 491 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCL12P48061 93 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP9P55211 416 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FMODQ06828 376 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NME3Q13232 169 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM78AQ5JUQ0 283 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADNP2Q6IQ32 1131 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B3GLCTQ6Y288 498 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSDL2Q6YN16 418 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEFB119Q8N690 84 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAT8LQ8N9F0 302 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATAD1Q8NBU5 361 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCT7Q99832 543 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT10Q9P0V9 454 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALG6Q9Y672 507 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.47□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.6 ms