RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 VWA1Q6PCB0 445 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF559Q9BR84 538 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ADA2Q9NZK5 511 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.62□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 A0A0B4J2E0 115 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 A0A1B0GX12 115 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 NPIPB7O75200 414 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 LYPD3O95274 346 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 THY1P04216 161 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 GGT1P19440 569 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CXCR1P25024 350 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OPRM1P35372 400 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 NCALDP61601 193 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SIRPAP78324 504 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 EGR4Q05215 589 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR1Q1Q15612 314 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FXNQ16595 210 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR2A2Q6IF42 318 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ACBD4Q8NC06 268 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 STARD4Q96DR4 205 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TRIM2Q9C040 744 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 JKAMPQ9P055 326 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.61□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MED12LQ86YW9 2145 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SULT2B1O00204 365 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FMO6PO60774 539 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RAMP1O60894 148 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PMS2P2O95744 297 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 IGFBP2P18065 325 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PTNP21246 168 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR1E2P47887 323 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RINLQ6ZS11 566 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FCRLAQ7L513 359 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CARM1Q86X55 608 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PROX1Q92786 737 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 DDIT4LQ96D03 193 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 NSL1Q96IY1 281 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MCHR1Q99705 422 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TIGARQ9NQ88 270 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CD300AQ9UGN4 299 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.6□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 LIPT2A6NK58 231 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 UBOX5O94941 541 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CGAP01215 116 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CRHP06850 196 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 HSD17B1P14061 328 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CALB2P22676 271 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 AGTR1P30556 359 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ASCL1P50553 236 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 MAP2K6P52564 334 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CDH12P55289 794 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 H3F3AP84243 136 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CEACAM7Q14002 265 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 C16orf89Q6UX73 402 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 P3H2Q8IVL5 708 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC38A4Q969I6 547 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 CDRT15Q96T59 188 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 PSD2Q9BQI7 771 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 C12orf10Q9HB07 376 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.59□□□□□ -0.07
GCN1-209ENST00000551920 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms