RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490439.1

NUP205-208, Transcript of nucleoporin 205, humanhuman

TSL 3

Gene NUP205, Length 653 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205-208ENST00000490439 ZNF69Q9UC07 566 aa6.7□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.7□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CUBNO60494 3623 aa6.7□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 A0A1W2PQD3 144 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TMEM114B3SHH9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 C9JVG2 144 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 G3V2L1 256 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ABCD4O14678 606 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 AZIN1O14977 448 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RIPK2O43353 540 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NDUFS7O75251 213 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 LINGO3P0C6S8 592 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SDC1P18827 310 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 GGT1P19440 569 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ENPP1P22413 925 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ASMTP46597 345 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CCT5P48643 541 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 P2RX1P51575 399 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 C21orf58P58505 322 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SELENBP1Q13228 472 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CCDC153Q494R4 210 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 STEAP3Q658P3 488 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CDC73Q6P1J9 531 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 Q6ZT83 130 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SSX8Q7RTT4 187 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TDRPQ86YL5 185 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 PHC2Q8IXK0 858 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CDS1Q92903 461 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 GIMAP5Q96F15 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 OR5B2Q96R09 309 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 STACQ99469 402 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 BEX2Q9BXY8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 EMC3Q9P0I2 261 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 X6R8D5 127 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ANK2Q01484 3957 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 DSCAMO60469 2012 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CIB4A0PJX0 185 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 FAM234BA2RU67 622 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 DPRXA6NFQ7 191 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SMIM23A6NLE4 172 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 COPEO14579 308 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CFLARO15519 480 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RAMP1O60894 148 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 LINC00032P0C843 101 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 NPIPA8P0DM63 369 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 UBL4AP11441 157 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CPA3P15088 417 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 PTNP21246 168 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 GCAP28676 217 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 ECHS1P30084 290 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SOAT1P35610 550 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 MAP3K8P41279 467 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 OR3A2P47893 321 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 DSCR9P59020 149 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 DNAJB13P59910 316 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RAC3P60763 192 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CBFBQ13951 182 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 RAB35Q15286 201 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 PGGHGQ32M88 737 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 DCST2Q5T1A1 773 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 LIPMQ5VYY2 423 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 SLC22A25Q6T423 547 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 CBLN3Q6UW01 205 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 IFT20Q8IY31 132 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.68□□□□□ -1.34
NUP205-208ENST00000490439 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms