RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 EGFP01133 1207 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 LCATP04180 440 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRSS2P07478 247 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CTSLP07711 333 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 LINC00271P0C7V0 271 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OCM2P0CE71 109 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 VPREB1P12018 145 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ANXA8P13928 327 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CSF2RAP15509 400 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 EPHA2P29317 976 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDHA2P29803 388 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 RRM2P31350 389 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 GGT2P36268 569 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 MMP12P39900 470 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OPRL1P41146 370 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SERPINB10P48595 397 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCR3P51677 355 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CRYBA2P53672 197 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 GAS1P54826 345 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TBPL1P62380 186 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SELENOWP63302 87 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CSNK2BP67870 215 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SIRPAP78324 504 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC35A2P78381 396 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 NTHL1P78549 312 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PHEXP78562 749 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 RBBP4Q09028 425 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 NPRL3Q12980 569 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 FADDQ13158 208 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDE7AQ13946 482 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 KRT33BQ14525 404 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 RGNQ15493 299 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CTF1Q16619 201 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 DGUOKQ16854 277 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 BCL7AQ4VC05 210 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 IFI44LQ53G44 452 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 C16orf87Q6PH81 154 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC80Q76M96 950 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC190Q86UF4 302 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 NAGSQ8N159 534 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 METTL4Q8N3J2 472 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OR9A1PQ8NGU1 263 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 DNASE1L2Q92874 299 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 NEUROG1Q92886 237 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 NEIL2Q969S2 332 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 OTUB2Q96DC9 234 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 WDR34Q96EX3 536 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 DTD2Q96FN9 168 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 C7orf34Q96L11 122 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 DOHHQ9BU89 302 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 KCNK15Q9H427 330 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 MMP25Q9NPA2 562 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYNNQ9NPC7 610 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 GDE1Q9NZC3 331 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 IL17BQ9UHF5 180 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 A0A1W2PRB8 838 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRBC2A0A5B9 178 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP50-201ENST00000487064 FUOMA2VDF0 154 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms