RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362378.1

RNU6-28P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 28, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-28P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR1L4Q8NGR5 311 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 FAM122AQ96E09 287 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 TIMD4Q96H15 378 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SEC22AQ96IW7 307 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PKIBQ9C010 78 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLITRK2Q9H156 845 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 METTL7AQ9H8H3 244 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NMRK1Q9NWW6 199 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SUN2Q9UH99 717 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 COPS3Q9UNS2 423 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 IFT52Q9Y366 437 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NPTNQ9Y639 398 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ARHGEF35A5YM69 484 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 K7N7A8 449 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 DCTN6O00399 190 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NDUFB10O96000 172 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR8U8P0C7N1 319 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF853P0CG23 659 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CCDC166P0CW27 439 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NPR2P20594 1047 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ANXA13P27216 316 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 AQP1P29972 269 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CALCRP30988 508 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NTSP30990 170 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 BTDP43251 543 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CDK16Q00536 496 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 IDI1Q13907 227 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SSX2Q16385 188 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 DUSP7Q16829 419 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CARD16Q5EG05 197 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SPINK14Q6IE38 97 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 EGFL6Q8IUX8 553 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 UBE2J2Q8N2K1 259 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ALLCQ8N6M5 410 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CD177Q8N6Q3 437 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NECAB1Q8N987 351 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR9K2Q8NGE7 335 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 AKR7LQ8NHP1 331 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ST8SIA1Q92185 356 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 RAPGEF5Q92565 580 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLCC1Q96S66 551 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 RNF2Q99496 336 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 GAL3ST1Q99999 423 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 TRIM62Q9BVG3 475 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NMUR2Q9GZQ4 415 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 EHD1Q9H4M9 534 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 REEP4Q9H6H4 257 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NIPAL2Q9H841 368 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC7A10Q9NS82 523 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ETNK2Q9NVF9 386 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM9Q9P0T7 183 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PPIAL4EA0A075B759 164 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 A0A0G2JRQ6 117 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF716A6NP11 495 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 GOLGA8SH3BPF8 625 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 IGHV3-48P01763 117 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF735P0CB33 412 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ETS2P15036 469 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 RFC4P35249 363 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC26A2P50443 739 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PKNOX1P55347 436 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 BIDP55957 195 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ISXQ2M1V0 245 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ENPP6Q6UWR7 440 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 ARCQ7LC44 396 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR52H1Q8NGJ2 320 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR9A1PQ8NGU1 263 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 NEIL2Q969S2 332 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 CXorf40BQ96DE9 158 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-28P-201ENST00000362378 PAGE5Q96GU1 130 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms