RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TEAD3Q99594 435 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 CDC42EP2O14613 210 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NPC1O15118 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NFYBP25208 207 aa6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 DECR1Q16698 335 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 GPR142Q7Z601 462 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KRT77Q7Z794 578 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NAA40Q86UY6 237 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 BEST3Q8N1M1 668 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 NR4A3Q92570 626 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 WBP2Q969T9 261 aa6.68□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 LYSMD1Q96S90 227 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TREM1Q9NP99 234 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 AHSPQ9NZD4 102 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GHRLQ9UBU3 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C5orf52A6NGY3 159 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 IFITM5A6NNB3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SYT5O00445 386 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PLPP1O14494 284 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 BCL2L11O43521 198 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TSPAN6O43657 245 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 LATS1O95835 1130 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 IGSF6O95976 241 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FGBP02675 491 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 HEXAP06865 529 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 CDK2P24941 298 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TP53I3Q53FA7 332 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CHST14Q8NCH0 376 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 WDR34Q96EX3 536 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RNF181Q9P0P0 153 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KLF15Q9UIH9 416 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR6C76A6NM76 312 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF879B4DU55 563 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 TXNL1O43396 289 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 KLF4O43474 513 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 RBBP9O75884 186 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ACTL6AO96019 429 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PRF1P14222 555 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SRMP19623 302 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 CAPZA1P52907 286 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 TAS2R20P59543 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PPP2CBP62714 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 PPP2CAP67775 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SSX6Q7RTT6 188 aa6.67□□□□□ -1.34
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