RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 NDE1Q9NXR1 346 aa14.91□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 LRRK2Q5S007 2527 aa14.91□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TMEM72A0PK05 275 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 HSPB2A8KAH6 182 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 M0R3H8 397 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 RCBTB2O95199 551 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TFPIP10646 304 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 CXCR1P25024 350 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 HTR2AP28223 471 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 SLC7A1P30825 629 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 CHRNB4P30926 498 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 HSPB2Q16082 182 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 SYT14P1Q58G82 188 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 RINLQ6ZS11 566 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 ASB5Q8WWX0 329 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 OR5B2Q96R09 309 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TRIM2Q9C040 744 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TIGARQ9NQ88 270 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 CD300AQ9UGN4 299 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 BAG5Q9UL15 447 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 ZNF175Q9Y473 711 aa14.9□□□□□ -0.02
IRF1-211ENST00000613424 DOCK7Q96N67 2140 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ZNF208O43345 1280 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CLDN14O95500 239 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 NCK1P16333 377 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 HTR1EP28566 365 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 MAP2K6P52564 334 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SELENOWP63302 87 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 OR1Q1Q15612 314 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 NPTX1Q15818 432 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 PROX1Q92786 737 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ARL5BQ96KC2 179 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 A0A1B0GWA3 101 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 A1L4Q6 167 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 AQP8O94778 261 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 UBOX5O94941 541 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SYNGR4O95473 234 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CLDN1O95832 211 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 HSD17B1P14061 328 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 GGT1P19440 569 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TNFRSF1BP20333 461 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CTSSP25774 331 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 RAC3P60763 192 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 NCALDP61601 193 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 FOXF2Q12947 444 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 BNIP2Q12982 314 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 GLYATQ6IB77 296 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 MED12LQ86YW9 2145 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 DDIT4LQ96D03 193 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 TPD52L3Q96J77 140 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 MCHR1Q99705 422 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 UCK2Q9BZX2 261 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.88□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.87□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 SULT2B1O00204 365 aa14.87□□□□□ -0.03
IRF1-211ENST00000613424 FMO6PO60774 539 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms