RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2B3O76000 313 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFNA16P05015 189 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HTR2AP28223 471 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NNATQ16517 81 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLBQ86Z14 1044 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB123Q8N688 67 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLKQ9UBE8 527 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42EP2O14613 210 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUX1O43812 170 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKCAP17252 672 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NR2C2APQ86WQ0 139 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFAND1Q8TCF1 268 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARVELD1Q9BSK0 173 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUTCQ9NTM9 273 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDH10Q9Y6N8 788 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM25AB3EWG3 89 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM25CB3EWG5 89 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM25GB3EWG6 89 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALX3O95076 343 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTBP2P56545 445 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAPQ12884 760 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MZT2AQ6P582 158 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VSTM2LQ96N03 204 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMP4Q99727 224 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GIMD1P0DJR0 217 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLB1P16278 677 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GALP22466 123 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSF2RBP32927 897 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR1D4P47884 311 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSD11B2P80365 405 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEX12Q9BXU0 123 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YIG0 161 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF749O43361 778 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV1D-16P01601 117 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GZMKP49863 264 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSD17B7P56937 341 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR1Q1Q15612 314 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPOQ8IVL8 374 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2T33Q8NG76 320 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD8Q96LT4 415 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLE3Q9NRF9 147 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAMEF2O60811 474 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR3P46089 330 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLAURQ03405 335 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRPEL2Q8TAA5 225 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM183AA6NL82 134 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELK1P19419 428 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 B3GLCTQ6Y288 498 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GON7Q9BXV9 100 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBQLN3Q9H347 655 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF13O43567 381 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC19A2O60779 497 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC43A1O75387 559 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMGN1P05114 100 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCGRP47871 477 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNK1Q13470 666 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHBQ15464 509 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR10A5Q9H207 317 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BMH7 237 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1QBP02746 253 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP6V1E1P36543 226 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BDH1Q02338 343 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms