RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730		A8MVM7	634 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		H0Y3Z8	333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		H3BML4	177 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T1	O43869	369 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	KRT36	O76013	467 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	RAP2A	P10114	183 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TFPI	P10646	304 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A2	Q01362	244 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	NPTX1	Q15818	432 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	RRM2B	Q7LG56	351 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TIMP4	Q99727	224 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0B4J2E0	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GUH1	482 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GX12	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	FRS3	O43559	492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SLC19A2	O60779	497 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	EPPIN	O95925	133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TPO	P07202	933 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CELA3A	P09093	270 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	FCGR1A	P12314	374 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	FCGR2A	P12318	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PRG2	P13727	222 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF708	P17019	499 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	GNLY	P22749	145 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	OR1E2	P47887	323 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TRAM2	Q15035	370 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SGCB	Q16585	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-224	ENST00000534730		A0A087WUJ7	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AHSA1	O95433	338 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SYNGR4	O95473	234 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	IGF2	P01344	180 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	IFNGR2	P38484	337 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	LHX2	P50458	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PLAUR	Q03405	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TAF11	Q15544	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GXYLT1	Q4G148	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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