RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GHSRQ92847 366 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 BADQ92934 168 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MENTQ9BUN1 341 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MS4A8Q9BY19 250 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 AICDAQ9GZX7 198 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A1Q9NY26 324 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 GPR34Q9UPC5 381 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A5Q9Y345 797 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GUH1 482 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PPV9 198 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SELENOFO60613 162 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 RLN2P04090 185 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 IFNGR1P15260 489 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EPHA4P54764 986 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR12D2P58182 307 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SHC2P98077 582 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 FGL1Q08830 312 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TRAM2Q15035 370 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TCEA2Q15560 299 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TMEM44Q2T9K0 475 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ADCK2Q7Z695 626 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 UBE3DQ7Z6J8 389 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 NKAIN4Q8IVV8 208 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 PM20D2Q8IYS1 436 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EDARQ9UNE0 448 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PS29 197 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR1F1O43749 312 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ATG12O94817 140 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 GALP22466 123 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 GMFBP60983 142 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF750Q32MQ0 723 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 FAM69AQ5T7M9 428 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 PXT1Q8NFP0 134 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ICKQ9UPZ9 632 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GW55 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 UBE2QL1A1L167 161 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D3BA6NDS4 549 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DISC1C4P0D8 188 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 APOC1P02654 83 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 AKR1C2P52895 323 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 CDK3Q00526 305 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 AKR1C1Q04828 323 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 LINC00303Q3SY05 128 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF311Q5JNZ3 666 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 HES5Q5TA89 166 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 CMIPQ8IY22 773 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR6V1Q8N148 313 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR5M9Q8NGP3 310 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 COX14Q96I36 57 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DERL3Q96Q80 235 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 MFFQ9GZY8 342 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EQTNQ9NQ60 294 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 AHSPQ9NZD4 102 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EMC3Q9P0I2 261 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 DUX4Q9UBX2 424 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 C4orf51C9J302 202 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ABCD4O14678 606 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EPPINO95925 133 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2ABP04908 130 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 EPXP11678 715 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF35P13682 527 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 STAT5AP42229 794 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 CDH26Q8IXH8 852 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-212ENST00000488380 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms