RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417504.5

PTPA-211, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 4

Gene PTPA, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-211ENST00000417504 HES7Q9BYE0 225 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DSN1Q9H410 356 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 REEP1Q9H902 201 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 MED11Q9P086 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 VDAC3Q9Y277 283 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TENM4Q6N022 2769 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 MAST4O15021 2626 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 C17orf51A8MQB3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 FAM166BA8MTA8 275 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 J3KTA2 159 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 FAAHO00519 579 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR5F1O95221 314 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 IMPDH2P12268 514 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 PRG2P13727 222 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZNF24P17028 368 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DPP4P27487 766 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 HTR2AP28223 471 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RRM2P31350 389 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 GCKP35557 465 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RFC3P40938 356 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ARHGDIAP52565 204 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZNF136P52737 540 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ST3GAL3Q11203 375 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 QPRTQ15274 297 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR1Q1Q15612 314 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 NPTX1Q15818 432 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ATP6AP1Q15904 470 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RAET1LQ5VY80 246 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZNF613Q6PF04 617 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR2M3Q8NG83 312 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 OR2T29Q8NH02 315 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ST8SIA1Q92185 356 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SCMH1Q96GD3 660 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 BDH2Q9BUT1 245 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DEPPQ9NTK1 212 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 RHCGQ9UBD6 479 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 U3KQE9 123 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 SVILO95425 2214 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 A0A087WZY1 265 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 A0A0B4J2E0 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 A0A1B0GWA3 101 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 A0A1B0GX12 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 H3BNX3 289 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TNFRSF11BO00300 401 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CLOCKO15516 846 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CHP2O43745 196 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TPST2O60704 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 CBR3O75828 277 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 TRAPPC6AO75865 159 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPA-211ENST00000417504 GADD45GO95257 159 aa7.35□□□□□ -1.23
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