RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 IL21RQ9HBE5 538 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 WDR81Q562E7 1941 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0B4J2A0 478 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 BCL2L11O43521 198 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 REM1O75628 298 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ATP1B1P05026 303 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 QDPRP09417 244 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ACKR3P25106 362 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TAF6P49848 677 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GAS1P54826 345 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MTAPQ13126 283 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TUSC3Q13454 348 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LIN54Q6MZP7 749 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 IP6K3Q96PC2 410 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GPA33Q99795 319 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SPON2Q9BUD6 331 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 BOCQ9BWV1 1114 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CHST6Q9GZX3 395 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RNF122Q9H9V4 155 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RHOFQ9HBH0 211 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NUMA1Q14980 2115 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DAPL1A0PJW8 107 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GGT3PA6NGU5 568 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NFATC1O95644 943 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 AGTR1P30556 359 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 AP1S1P61966 158 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TNFRSF9Q07011 255 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LIPJQ5W064 366 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR2A2Q6IF42 318 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR5W2Q8NH69 310 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ABHD4Q8TB40 342 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SMPDL3BQ92485 455 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LANCL2Q9NS86 450 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR5H14A6NHG9 310 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FLRT2O43155 660 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TGM5O43548 720 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SLC2A10O95528 541 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NTN1O95631 604 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 IFNA17P01571 189 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ACP5P13686 325 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ACVR1Q04771 509 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CHIT1Q13231 466 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DHCR24Q15392 516 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MPPED2Q15777 294 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FRG2Q64ET8 278 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FRG2BQ96QU4 278 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CHST8Q9H2A9 424 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MED20Q9H944 212 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 BCO1Q9HAY6 547 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 EREGO14944 169 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0355O15063 1070 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LDLRAD4O15165 306 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ANXA5P08758 320 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MC1RQ01726 317 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ABHD13Q7L211 337 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FCRLAQ7L513 359 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms