RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 LCTLQ6UWM7 567 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NOX4Q9NPH5 578 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CLDND1Q9NY35 253 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 IL20Q9NYY1 176 aa12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 BRWD1Q9NSI6 2320 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 UNC119BA6NIH7 251 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 SLC19A2O60779 497 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LILRB3O75022 631 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 IGF2P01344 180 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MAZP56270 477 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 GUCA2AQ02747 115 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 GPR139Q6DWJ6 353 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 IDO2Q6ZQW0 420 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR11G2Q8NGC1 345 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR5K2Q8NHB8 316 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 STK35Q8TDR2 534 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CXorf40AQ8TE69 158 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 WDR34Q96EX3 536 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CD180Q99467 661 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 APOC3P02656 99 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LPLP06858 475 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 EDNRAP25101 427 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ZNF33BQ06732 778 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ZNF511Q8NB15 262 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CERS4Q9HA82 394 aa12□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 C17orf51A8MQB3 221 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LATS1O95835 1130 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MAS1P04201 325 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 GLULP15104 373 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PGDP52209 483 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NDUFA9Q16795 377 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LINC00303Q3SY05 128 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 SNX33Q8WV41 574 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NMNAT3Q96T66 252 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PINK1Q9BXM7 581 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ASB4Q9Y574 426 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CARNS1A5YM72 827 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MT-ND5P03915 603 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 DRD2P14416 443 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 IFNGR2P38484 337 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 P2RY2P41231 377 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 SEC13P55735 322 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PRR5P85299 388 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CDK3Q00526 305 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 HSF2Q03933 536 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OPCMLQ14982 345 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR1Q1Q15612 314 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 OR6M1Q8NGM8 313 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PGLYRP3Q96LB9 341 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 WDR26Q9H7D7 661 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MARK1Q9P0L2 795 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NTMQ9P121 344 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PP55 124 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 H0Y8X5 98 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 IGHA1P01876 353 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 CTSBP07858 339 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 NGFRP08138 427 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 LAMP2P13473 410 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PCSK2P16519 638 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 REEP5Q00765 189 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 HTR4Q13639 388 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 MEIOBQ8N635 442 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 TMEM239Q8WW34 195 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 RASD2Q96D21 266 aa11.99□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 A0A1B0GVI7 797 aa11.98□□□□□ -0.49
SNX1-201ENST00000261889 PRR32B1ATL7 298 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms