RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZAR1Q86SH2 424 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 COX18Q8N8Q8 333 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GATSQ8NAP1 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF527Q8NB42 609 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 NEUROG1Q92886 237 aa4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 STACQ99469 402 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 PSD2Q9BQI7 771 aa4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.86□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TIMM22Q9Y584 194 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 DPRXA6NFQ7 191 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 ZNF724A8MTY0 619 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 VSTM5A8MXK1 200 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 H3BNH8 94 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 H7C417 338 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 ABCD4O14678 606 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CYTIPO60759 359 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 GLRA3O75311 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 PGM3O95394 542 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 CD8AP01732 235 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 UROSP10746 265 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 MYL2P10916 166 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 SLC25A16P16260 332 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 PRKCAP17252 672 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 TSC22D1Q15714 1073 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 MTERF3Q96E29 417 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-229ENST00000638939 REEP4Q9H6H4 257 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 OXSMQ9NWU1 459 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-229ENST00000638939 C1orf109Q9NX04 203 aa4.85□□□□□ -1.63
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