RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-210ENST00000580357 SPATA21Q7Z572 469 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 SERPINA11Q86U17 422 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 VRK2Q86Y07 508 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 SLC43A2Q8N370 569 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 HIPK4Q8NE63 616 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 MAL2Q969L2 176 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 GP6Q9HCN6 339 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.73□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 C19orf84I3L1E1 186 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 MSTNO14793 375 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 KRT34O76011 436 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 IL11P20809 199 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PRKAR1BP31321 381 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 LSP1P33241 339 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PCYT1AP49585 367 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 FOXF2Q12947 444 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ZNF524Q96C55 264 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 LRRC58Q96CX6 371 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ADAM19Q9H013 955 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 NANOGQ9H9S0 305 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.72□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 MRASO14807 208 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ZNF208O43345 1280 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TNFSF13O75888 250 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 SSTR2P30874 369 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CTBP2P56545 445 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ADRM1Q16186 407 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CYP51A1Q16850 503 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 SYT14P1Q58G82 188 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 DDIT4LQ96D03 193 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 C14orf79Q96F83 325 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 OR5B2Q96R09 309 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 ECSITQ9BQ95 431 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 FANCFQ9NPI8 374 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 RLIMQ9NVW2 624 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.71□□□□□ -0.05
IFT20-210ENST00000580357 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 A8MXE2 369 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 AQP8O94778 261 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PRKD3O94806 890 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 TFPIP10646 304 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CD8BP10966 210 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 CXCR1P25024 350 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 UQCRC1P31930 480 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SEC24CP53992 1094 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 SORDQ00796 357 aa14.7□□□□□ -0.06
IFT20-210ENST00000580357 PLAURQ03405 335 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms