RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GHSR	Q92847	366 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ABCG5	Q9H222	651 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	WDR70	Q9NW82	654 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MCUB	Q9NWR8	336 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	WBP1L	Q9NX94	342 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		A6NL46	340 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RFPL3	O75679	317 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CBX7	O95931	251 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RAB3B	P20337	219 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	AHCY	P23526	432 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF550	Q7Z398	422 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SYS1	Q8N2H4	156 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF614	Q8N883	585 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL1	Q9NR64	748 aa		16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JK05	382 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ARL6IP5	O75915	188 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T7	P0C7T2	308 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PVR	P15151	417 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PITPNA	Q00169	270 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PLA1A	Q53H76	456 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ULK3	Q6PHR2	472 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T27	Q8NH04	317 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MFRP	Q9BY79	579 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG2	Q9Y698	323 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR5K4	A6NMS3	321 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FZD7	O75084	574 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	DHFR	P00374	187 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	EGF	P01133	1207 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CLU	P10909	449 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACVR1B	P36896	505 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	LSS	P48449	732 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR10A3	P58181	314 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS3BP	Q08380	585 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZAR1	Q86SH2	424 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OOSP2	Q86WS3	158 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		16.97	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JNG1	304 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	AGRP	O00253	132 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OGG1	O15527	345 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB2	O95178	105 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PAH	P00439	452 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CD1A	P06126	327 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS5	Q14953	304 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		Q5BKY6	102 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR5J2	Q8NH18	312 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		16.96	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	NOTO	A8MTQ0	251 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ALX3	O95076	343 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TNF	P01375	233 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CTH	P32929	405 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GPR143	P51810	404 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PSG6	Q00889	435 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GGTLC2	Q14390	218 aa		16.96	■□□□□ 0.3

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