RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555894.5

TTC7B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 3

Gene TTC7B, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-208	ENST00000555894	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SULT2B1	O00204	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KLF11	O14901	512 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	UBD	O15205	165 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CHRM4	P08173	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FPR1	P21462	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	DIO1	P49895	249 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GNA13	Q14344	377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ACKR1	Q16570	336 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	COX20	Q5RI15	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PIGT	Q969N2	578 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ROS1	P08922	2347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	FES	P07332	822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IL7R	P16871	459 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IL32	P24001	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	NR1H2	P55055	460 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MIER2	Q8N344	545 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	ITCH	Q96J02	903 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CCL19	Q99731	98 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	NF1	P21359	2839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTC7B-208	ENST00000555894	KLF4	O43474	513 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CYTIP	O60759	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SMPD2	O60906	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	UQCRB	P14927	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	CRAT	P43155	626 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MAGEA8	P43361	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	HTR3A	P46098	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	STX1B	P61266	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PLAUR	Q03405	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	P2RY6	Q15077	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PMM1	Q92871	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTC7B-208	ENST00000555894	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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