RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS27Q9BQR3 290 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM19Q9H013 955 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A5Q9Y345 797 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-208ENST00000524325 MED12Q93074 2177 aa20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FAAHO00519 579 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5F1O95221 314 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF24P17028 368 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SRD5A2P31213 254 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 AAGABQ6PD74 315 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF613Q6PF04 617 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX19Q8NA77 164 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF347Q96SE7 839 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 YY1AP1Q9H869 796 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 GADD45GO95257 159 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 LDLRP01130 860 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC23BQ15437 767 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6AP1Q15904 470 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ULK3Q6PHR2 472 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ANPEPP15144 967 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 GRINAQ7Z429 371 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM234Q8WY98 164 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ST8SIA1Q92185 356 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2M5A3KFT3 312 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFRSF11BO00300 401 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 MGRN1O60291 552 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ST3GAL3Q11203 375 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SMPDL3BQ92485 455 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 REEP1Q9H902 201 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SELENONQ9NZV5 590 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM72A0PK05 275 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA5E9PKD4 350 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT7O00154 380 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PIP5K1CO60331 668 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SHC1P29353 583 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 STARP49675 285 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOA3Q8NG57 546 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC38A4Q969I6 547 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA1Q9UND3 350 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BML4 177 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CHP2O43745 196 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 E2F6O75461 281 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 HPNP05981 417 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKACGP22612 351 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC10A1Q14973 349 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PFN4Q8NHR9 129 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SFXN2Q96NB2 322 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms