RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC37A3Q8NCC5 494 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 BPIFA2Q96DR5 249 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ART5Q96L15 291 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA12BQ96MM6 686 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TBX5Q99593 518 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GON7Q9BXV9 100 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RP1P56715 2156 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 DAPL1A0PJW8 107 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CYR61O00622 381 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GZMKP49863 264 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CTBP2P56545 445 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MGAT2Q10469 447 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SNAP47Q5SQN1 464 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFAND1Q8TCF1 268 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NLKQ9UBE8 527 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR75O95800 540 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKCAP17252 672 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5EP21589 574 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 OR13C2Q8NGS9 318 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 UPRTQ96BW1 309 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TEAD3Q99594 435 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MAT2BQ9NZL9 334 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM86C2PA6NEL3 165 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC43A1O75387 559 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ELK1P19419 428 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GALK2Q01415 458 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 DMWDQ09019 674 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PARGQ86W56 976 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9A4Q8NGU2 314 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5W2Q8NH69 310 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-CQ95604 372 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NIPAL2Q9H841 368 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM36Q9NQ86 728 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 INPP5EQ9NRR6 644 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM5Q9Y2B1 443 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HRO43593 1189 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 BRINP1O60477 761 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RDH16O75452 317 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 REM1O75628 298 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GLULP15104 373 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 BCKDHBP21953 392 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 AMZ1Q400G9 498 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL12Q53G59 568 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK20Q8IZL9 346 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PMM1Q92871 262 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT27Q9BW83 186 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PTP4A3O75365 173 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CT62P0C5K7 136 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CD53P19397 219 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TNK1Q13470 666 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HBMQ6B0K9 141 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF687Q8N1G0 1237 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC3Q9BQI4 270 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MED31Q9Y3C7 131 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GXYLT2A0PJZ3 443 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf74A8MZ97 194 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PI62 339 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PLPP2O43688 288 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 AK1P00568 194 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 C1QBP02746 253 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GFERP55789 205 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 IDNKQ5T6J7 187 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF613Q6PF04 617 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CTHRC1Q96CG8 243 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K3Q99759 626 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SPACA6W5XKT8 324 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RFPL3O75679 317 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 DRD5P21918 477 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 F8A1P23610 371 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms