RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 RFPL3O75679 317 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 BTCP35070 178 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 NTRK2Q16620 822 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 MANEAQ5SRI9 462 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 FCRLBQ6BAA4 426 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 CCL4L1Q8NHW4 92 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 GRHL3Q8TE85 626 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 GHSRQ92847 366 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 CTHRC1Q96CG8 243 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 ABHD1Q96SE0 405 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 KLHL1Q9NR64 748 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 CDH23Q9H251 3354 aa25.84■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 A0A0A6YYJ9 748 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 C7orf66A4D0T2 115 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 H0YGG7 62 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-2O95096 273 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 APBB3O95704 486 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 CLUP10909 449 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 ACVR1BP36896 505 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 TMEM52Q8NDY8 209 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 OR7G1Q8NGA0 311 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 OR10G6Q8NH81 332 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 DPAGT1Q9H3H5 408 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 SCML1Q9UN30 329 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 C5orf42Q9H799 3197 aa25.83■■□□□ 1.73
UBP1-201ENST00000283628 GXYLT2A0PJZ3 443 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 OR6C74A6NCV1 312 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 PYCR1P32322 319 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 PITPNAQ00169 270 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ANGPT1Q15389 498 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 CYB561A3Q8NBI2 242 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 OR5J2Q8NH18 312 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TRIM2Q9C040 744 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 MED28Q9H204 178 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ABRACLQ9P1F3 81 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SERTAD3Q9UJW9 196 aa25.83■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GWA3 101 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 GUSBP08236 651 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 HTR2BP41595 481 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ACTA2P62736 377 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ACTG2P63267 376 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 RPTNQ6XPR3 784 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 CADM2Q8N3J6 435 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 MFRPQ9BY79 579 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 FLRT3Q9NZU0 649 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa25.82■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 OGG1O15527 345 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 UBL3O95164 117 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SYS1Q8N2H4 156 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SCMH1Q96GD3 660 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 MCCC2Q9HCC0 563 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 NOTOA8MTQ0 251 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 CT62P0C5K7 136 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 MMP15P51511 669 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 GPR18Q14330 331 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SLC36A2Q495M3 483 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 BCL2L15Q5TBC7 163 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 KRT74Q7RTS7 529 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 LRRC17Q8N6Y2 441 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 POMGNT2Q8NAT1 580 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 FAM3CQ92520 227 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 PEX11GQ96HA9 241 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 STMN3Q9NZ72 180 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 COPZ2Q9P299 210 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 FBXL4Q9UKA2 621 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 HSPB11Q9Y547 144 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 COL4A2P08572 1712 aa25.81■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF10CO14798 259 aa25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 ARL6IP5O75915 188 aa25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 LSMEM1Q8N8F7 131 aa25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 SNAPC3Q92966 411 aa25.8■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 RASGRP1O95267 797 aa25.79■■□□□ 1.72
UBP1-201ENST00000283628 GPLD1P80108 840 aa25.79■■□□□ 1.72
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