RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 VSNL1P62760 191 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP2R2BQ00005 443 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 EMX2Q04743 252 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SKP2Q13309 424 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGADQ13349 1161 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 HSD17B8Q92506 261 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL8AQ96BM9 186 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 OR5B2Q96R09 309 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 LAT2Q9GZY6 243 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 NGBQ9NPG2 151 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS50Q9UI38 385 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 MKLN1Q9UL63 735 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 DUXAA6NLW8 204 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 TYROBPO43914 113 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 TMCC2O75069 709 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 STX11O75558 287 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 LYZL6O75951 148 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CSTAP01040 98 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 FESP07332 822 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 OR12D1P0DN82 309 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ETV4P43268 484 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SESN3P58005 492 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 BSPH1Q075Z2 132 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 MERTKQ12866 999 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 FAPQ12884 760 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 TNK1Q13470 666 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 STK11Q15831 433 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF141Q15928 474 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD46Q86W74 232 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ST8SIA1Q92185 356 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXW5Q969U6 566 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 PSD2Q9BQI7 771 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 OR51I1Q9H343 314 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 BCO1Q9HAY6 547 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ACER3Q9NUN7 267 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ASIC5Q9NY37 505 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 DPRXA6NFQ7 191 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF223E7ERA6 249 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 OVOL3O00110 214 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT2B1O00204 365 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CYTIPO60759 359 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJA2O60884 412 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 RAMP1O60894 148 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 UGT2B17O75795 530 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 AK1P00568 194 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 DANCRP0C864 163 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKN1AP38936 164 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 DIO1P49895 249 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 VEZF1Q14119 521 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CHI3L2Q15782 390 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPK14Q16539 360 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 SYT14P1Q58G82 188 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZT83 130 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms