RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 JKAMPQ9P055 326 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 STOML1Q9UBI4 398 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SYT5O00445 386 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 DBIP07108 87 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ARAFP10398 606 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 IL7RP16871 459 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 UQCRC1P31930 480 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 MERTKQ12866 999 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SELPLGQ14242 412 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GUSBP1Q15486 140 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 LIN52Q52LA3 116 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CMIPQ8IY22 773 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PEX5LQ8IYB4 626 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 DPP10Q8N608 796 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OR52P1PQ8NH57 321 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 NFKBIDQ8NI38 313 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF563Q8TA94 476 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 C10orf82Q8WW14 230 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OSTF1Q92882 214 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 STARD4Q96DR4 205 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ACER3Q9NUN7 267 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RLIMQ9NVW2 624 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CALML5Q9NZT1 146 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CLEC4AQ9UMR7 237 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GMEB1Q9Y692 573 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PNR3 127 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FBP2O00757 339 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ANGPT2O15123 496 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OR2A2Q6IF42 318 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PMM1Q92871 262 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CGREF1Q99674 301 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC106Q9BWC9 280 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SAR1AQ9NR31 198 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 KLHL14Q9P2G3 628 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ABCA12Q86UK0 2595 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 A0A0G2JPF8 293 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CDHR4A6H8M9 788 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM247A6NEH6 219 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PGM3O95394 542 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SYNGR4O95473 234 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CRHP06850 196 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GKN3PP0CG01 181 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FCGR2AP12318 317 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GPX2P18283 190 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 KLK2P20151 261 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CARD18P57730 90 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 MTPNP58546 118 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 EPS8Q12929 822 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 KLF10Q13118 480 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 NFYCQ13952 458 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GNA13Q14344 377 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PDSS1Q5T2R2 415 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 BBS10Q8TAM1 723 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TSPEARQ8WU66 669 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM234Q8WY98 164 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 DNAJA3Q96EY1 480 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GALNT8Q9NY28 637 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 APCP25054 2843 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CFAP73A6NFT4 308 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GJE1A6NN92 205 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 A8MXE2 369 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 C5orf58C9J3I9 102 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms