RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LILRA2Q8N149 483 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POC1BQ8TC44 478 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GPR119Q8TDV5 335 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PMM1Q92871 262 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SPDL1Q96EA4 605 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TEX37Q96LM6 180 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL15Q96M94 604 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EBF4Q9BQW3 602 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POLE3Q9NRF9 147 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MKLN1Q9UL63 735 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LIPT1Q9Y234 373 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LPI6 279 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YW62 118 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PP18 115 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SERINC4A6NH21 518 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GJE1A6NN92 205 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NR5A2O00482 541 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2B17O75795 530 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GOSR1O95249 250 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CSTAP01040 98 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPPAP01160 153 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CGAP01215 116 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR12D1P0DN82 309 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CD8BP10966 210 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRKCAP17252 672 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ADH6P28332 368 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SHC1P29353 583 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 IL12AP29459 219 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCKARP32238 428 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CD79BP40259 229 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ5P48544 419 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ART1P52961 327 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GYS2P54840 703 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CTBP2P56545 445 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FADDQ13158 208 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SELENBP1Q13228 472 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CBFBQ13951 182 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 QPRTQ15274 297 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF141Q15928 474 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 AGKQ53H12 422 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA21Q7Z572 469 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CDC20BQ86Y33 519 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR5W2Q8NH69 310 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO27Q8NI29 283 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RAB8BQ92930 207 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NINJ1Q92982 152 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ROPN1LQ96C74 230 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MARK4Q96L34 752 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DACH2Q96NX9 599 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SH3GL1Q99961 368 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LIME1Q9H400 295 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TIGARQ9NQ88 270 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CALML5Q9NZT1 146 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PROCRQ9UNN8 238 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 WDR45Q9Y484 360 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms