RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 SDF2Q99470 211 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TM9SF2Q99805 663 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CALHM2Q9HA72 323 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 GNG8Q9UK08 70 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PHYHO14832 338 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CDKN2CP42773 168 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TAS2R43P59537 309 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CBLL1Q75N03 491 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 BCORP1Q8N888 145 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 STON2Q8WXE9 905 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SPTSSAQ969W0 71 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LUZP4Q9P127 313 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 OR2W5A6NFC9 320 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 RHAGQ02094 409 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PIGGQ5H8A4 983 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CHST4Q8NCG5 386 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT9Q9BW91 350 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 WDR54Q9H977 334 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.99□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LINC01387J3KSC0 135 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 VAMP5O95183 116 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CHRM4P08173 479 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT7P0C024 238 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SLC6A19Q695T7 634 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 BORAQ6PGQ7 559 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SYT14Q8NB59 555 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CACNA1BQ00975 2339 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 GGT3PA6NGU5 568 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NID1P14543 1247 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 GPX2P18283 190 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ACP1P24666 158 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 MLLT10P55197 1068 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PDE7AQ13946 482 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SAMD8Q96LT4 415 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 A0A087WZY1 265 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ARL6IP5O75915 188 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT6P53370 316 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SELENBP1Q13228 472 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TPK1Q9H3S4 243 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.98□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 A0A1B0GWA3 101 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DVL2O14641 736 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 KCNK2O95069 426 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PPP1R3DO95685 299 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 HCKP08631 526 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ITGA5P08648 1049 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 DRD5P21918 477 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 PRPH2P23942 346 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF613Q6PF04 617 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ST8SIA1Q92185 356 aa9.97□□□□□ -0.81
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms