RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 MOAP1Q96BY2 351 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SDF2Q99470 211 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 DUSP26Q9BV47 211 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 GP6Q9HCN6 339 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.04■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 CLOCKO15516 846 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ZNF264O43296 627 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 TMCC2O75069 709 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ADAP00813 363 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 G6PDP11413 515 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A1P30825 629 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SOAT1P35610 550 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB5P36952 375 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 CCR4P51679 360 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SELENBP1Q13228 472 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 QPRTQ15274 297 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 OR5W2Q8NH69 310 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 USF3Q68DE3 2245 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SERINC4A6NH21 518 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ESPNB1AK53 854 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ZNF814B7Z6K7 855 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 INAFM1C9JVW0 142 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 NUDT17P0C025 328 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 UBL4AP11441 157 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 CREB1P16220 341 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 MATN1P21941 496 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 RAC3P60763 192 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 P2RY6Q15077 328 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 PGS1Q32NB8 556 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4FQ8N1N0 589 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SLC43A2Q8N370 569 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B8Q92506 261 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 NEUROG1Q92886 237 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 L2HGDHQ9H9P8 463 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 BCO1Q9HAY6 547 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 NGBQ9NPG2 151 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
HERC3-211ENST00000513325 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 C9JVG2 144 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CYP7B1O75881 506 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 H6PDO95479 791 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 BPGMP07738 259 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CD3EP07766 207 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SOD3P08294 240 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CLDN8P56748 225 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R2BQ00005 443 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ITGADQ13349 1161 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TNK1Q13470 666 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CBFBQ13951 182 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 GPR68Q15743 365 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PSD2Q9BQI7 771 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PRSS50Q9UI38 385 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 FREM1Q5H8C1 2179 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 DUXAA6NLW8 204 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 FCMRO60667 390 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 STX11O75558 287 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 DANCRP0C864 163 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 EDNRAP25101 427 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR3A2P47893 321 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 C21orf58P58505 322 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 EMX2Q04743 252 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SKP2Q13309 424 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF141Q15928 474 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZT83 130 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms