RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SLC7A1P30825 629 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GZMKP49863 264 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 FABP6P51161 128 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 EDNRAP25101 427 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 PTAFRP25105 342 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 P2RX1P51575 399 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 FAM166AQ6J272 317 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CBLN3Q6UW01 205 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 JADE3Q92613 823 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CHODLQ9H9P2 273 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PNR3 127 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF724A8MTY0 619 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 H3BNH8 94 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 BMP4P12644 408 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CD40P25942 277 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF83P51522 516 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 EFNA4P52798 201 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SELENBP1Q13228 472 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 LIPNQ5VXI9 398 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 IL17RELQ6ZVW7 336 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 LCA5Q86VQ0 697 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF527Q8NB42 609 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 BTBD2Q9BX70 525 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CARD8Q9Y2G2 431 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SVEP1Q4LDE5 3571 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 OIP5O43482 229 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CYTIPO60759 359 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SEC22BO75396 215 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 FAM153BP0C7A2 387 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 PRKCAP17252 672 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 HNF1AP20823 631 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ATP6V1C1P21283 382 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CHRNEQ04844 493 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SPOCK1Q08629 439 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 FAM153CQ494X1 144 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF544Q6NX49 715 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 OR52N5Q8NH56 324 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GPR119Q8TDV5 335 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 PPCDCQ96CD2 204 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 HOXD1Q9GZZ0 328 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 PPCSQ9HAB8 311 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 GIN1Q9NXP7 522 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 SH3BP4Q9P0V3 963 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-210ENST00000491139 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 CIB4A0PJX0 185 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 SLC35F4A4IF30 521 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 CRCPO75575 148 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 RAD51DO75771 328 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 CHRNB3Q05901 458 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 KLHL26Q53HC5 615 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 ZNF385BQ569K4 471 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 INPP5KQ9BT40 448 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 REEP4Q9H6H4 257 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 DUSP22Q9NRW4 184 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.33■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.32■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 AKAP10O43572 662 aa18.32■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NELFE-210ENST00000491139 FRKP42685 505 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms