RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486166.1

RBBP7-211, Transcript of RB binding protein 7, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBBP7, Length 1,535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7-211ENST00000486166 DDAH2O95865 285 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SDC1P18827 310 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 NT5EP21589 574 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PTGER1P34995 402 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SLC15A1P46059 708 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SLURP1P55000 103 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ERVK-8P63133 956 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ARG2P78540 354 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 KLRB1Q12918 225 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ADIPOQQ15848 244 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 GSTA3Q16772 222 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ACER2Q5QJU3 275 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 MORN4Q8NDC4 146 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SETD9Q8NE22 299 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 TSSK3Q96PN8 268 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 NPAS2Q99743 824 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 C1orf50Q9BV19 199 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 NUF2Q9BZD4 464 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 MYNNQ9NPC7 610 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HAO1Q9UJM8 370 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SPTA1P02549 2419 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 B8ZZF3 427 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 KLF11O14901 512 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ZFAND5O76080 213 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LRATO95237 230 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 WDPCPO95876 746 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CT62P0C5K7 136 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 BCKDHAP12694 445 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SLC37A1P57057 533 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 MEP1AQ16819 746 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 VMACQ2NL98 169 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 IL23RQ5VWK5 629 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HSDL2Q6YN16 418 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 USP51Q70EK9 711 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HPS6Q86YV9 775 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 BEST3Q8N1M1 668 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LIX1Q8N485 282 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ZNF721Q8TF20 911 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 PGAM5Q96HS1 289 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 FBXL20Q96IG2 436 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 FCRL1Q96LA6 429 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ZNF681Q96N22 645 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 AP4M1O00189 453 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 IGKV3-11P04433 115 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 DUSP1P28562 367 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 DIO1P49895 249 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 GAB1Q13480 694 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LTB4RQ15722 352 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 HAS2Q92819 552 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 ART5Q96L15 291 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.12□□□□□ -0.95
RBBP7-211ENST00000486166 EHD3Q9NZN3 535 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms