RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	IL10RA	Q13651	578 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK14	Q16539	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	THRSP	Q92748	146 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A087WUJ7	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		J3QRE1	110 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	IMPA2	O14732	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PLD2	O14939	933 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ARPC3	O15145	178 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXS1	O43638	330 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PTP4A3	O75365	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	LYPD3	O95274	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CH25H	O95992	272 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	THY1	P04216	161 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CT62	P0C5K7	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GKN3P	P0CG01	181 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	S1PR1	P21453	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TBXA2R	P21731	343 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TGFBR1	P36897	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TALDO1	P37837	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	GRK6	P43250	576 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CENPA	P49450	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	STARD6	P59095	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HSD11B2	P80365	405 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	RIN1	Q13671	783 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	C22orf42	Q6IC83	251 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MNT	Q99583	582 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K3	Q99759	626 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC22A4	Q9H015	551 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM60A	Q9NP50	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	SNPH	O15079	494 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF13	O43567	381 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-222	ENST00000459758	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms