RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 Q3ZCU0 254 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK15Q8TD08 544 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 BIRC7Q96CA5 298 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMD4Q96H15 378 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf42Q96LP6 360 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 STARD10Q9Y365 291 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 EVPLQ92817 2033 aa3.99□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ATRNO75882 1429 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAC2D3DTV9 90 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CETN3O15182 167 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RS1O15537 224 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NMT2O60551 498 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RAMP3O60896 148 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT36O76013 467 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 JCHAINP01591 159 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 STAG3L2P0CL84 134 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GSTM3P21266 225 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CALML3P27482 149 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FCGR2CP31995 323 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ACLYP53396 1101 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYBA2P53672 197 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DCST2Q5T1A1 773 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00523Q86TU6 105 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LACC1Q8IV20 430 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N1X5 172 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6S1Q8NH40 331 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NUS1Q96E22 293 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HMCESQ96FZ2 354 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLITRK2Q9H156 845 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5DC2Q9H857 520 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OARD1Q9Y530 152 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MSH6P52701 1360 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PRXQ9BXM0 1461 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.98□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PR80 420 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC182A6NF36 153 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CD8B2A6NJW9 211 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ERQ8 282 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 HIP1O00291 1037 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 WWP2O00308 870 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RAMP1O60894 148 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CEACAM4O75871 244 aa3.97□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms