RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADOQ96SZ5 270 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM64BA6NI03 449 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REM1O75628 298 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAKP20794 623 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNLIPRP2P54317 469 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF4P78317 190 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST3GAL4Q11206 333 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCN10Q6JVE6 187 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOOLQ6UXV4 268 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM163Q8TC26 289 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF217Q8TC41 542 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX12Q9BXU0 123 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPH1Q9BZG8 443 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 R4GN57 208 aa20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQD3 144 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B4E171 279 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H3BMQ9 156 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF9O60383 454 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL4P13236 92 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCD3P28288 659 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN7P41732 249 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPZ1P61923 177 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRF3Q14653 427 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNAPC1Q16533 368 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR22Q8IZ63 422 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CADM2Q8N3J6 435 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX19Q8N4C7 294 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OMA1Q96E52 524 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG8Q96MW5 612 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRB3Q9BUF7 120 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDCA4Q9BXL8 241 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED17Q9NVC6 651 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SELENONQ9NZV5 590 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC14CA4D256 554 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF264O43296 627 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ICOSLGO75144 302 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STSP08842 583 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT14P1Q58G82 188 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSDL2Q6YN16 418 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR2T33Q8NG76 320 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR4Q3Q8NH05 313 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUBPLQ8TB37 319 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VMP1Q96GC9 406 aa20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF28P17035 718 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTNP21246 168 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGGHGQ32M88 737 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR8K3Q8NH51 312 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANK1Q8TC84 345 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPAR4Q99677 370 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR52D1Q9H346 318 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0C4DFX4 3053 aa20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087WUJ7 227 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALG1L2C9J202 215 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFPL3O75679 317 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCBTB2O95199 551 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD59P13987 128 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FXYD6P3P58550 94 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf49Q96BT1 292 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRR1Q96L50 414 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAT2Q9GZY6 243 aa20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms