RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PILRAQ9UKJ1 303 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKDD1BA6NHY2 528 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 NOTOA8MTQ0 251 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 STK17BO94768 372 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K3P46734 347 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB25P57735 213 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC4P59998 168 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LCTLQ6UWM7 567 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DEF8Q6ZN54 512 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCK2Q7Z695 626 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR7Q86WK9 346 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A13Q8TCU3 470 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC9Q92623 222 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SOSTQ9BQB4 213 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB4Q9Y574 426 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NL46 340 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 WWP2O00308 870 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PRODHO43272 600 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKYO43930 277 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 STATHP02808 62 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAR1AP10644 381 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ETV1P50549 477 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MXD1Q05195 221 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MLC1Q15049 377 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIQKQ629K1 86 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf120Q7Z4R8 191 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBGQ9H310 441 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 FEZF1A0PJY2 475 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MV72 311 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G10O15496 165 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GPC1P35052 558 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL3P43628 341 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TNK1Q13470 666 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GINS1Q14691 196 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LRR1Q96L50 414 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC11Q9BVV2 318 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 A4GNTQ9UNA3 340 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA7AO75326 666 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf64Q86WR6 236 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL6Q8NI99 470 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 HMGN4O00479 90 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRG1O75711 98 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QBP02746 253 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPKBP27987 946 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R1BP30154 601 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK12P53778 367 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1G2P78368 415 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D19Q8N5T2 526 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ING3Q9NXR8 418 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR2B3O76000 313 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNGR2P38484 337 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ABATP80404 500 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CLN3Q13286 438 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 GNA13Q14344 377 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MINDY4Q4G0A6 757 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PODNL1Q6PEZ8 512 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MACROD1Q9BQ69 325 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-201ENST00000246533 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF749O43361 778 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GALP22466 123 aa24.32■■□□□ 1.48
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