RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO1C	O00159	1063 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CYR61	O00622	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGA5	P08648	1049 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CECR9	P0C854	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EMD	P50402	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD18	P57730	90 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DAG1	Q14118	895 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	E2F2	Q14209	437 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DPYSL2	Q16555	572 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZS46	218 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC43A2	Q8N370	569 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL17	Q92583	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG3	Q92685	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OMA1	Q96E52	524 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY12	Q9H244	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FN3K	Q9H479	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF702P	Q9H963	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NANOG	Q9H9S0	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RETN	Q9HD89	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A088AWK7	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JN53	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0J9YW62	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		C9JVG2	144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	F2RL2	O00254	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A8	O95907	504 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EPO	P01588	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MME	P08473	750 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SBK2	P0C263	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA2	P25787	234 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB25	P57735	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TGFBR3	Q03167	851 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NNAT	Q16517	81 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	HAGH	Q16775	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IL23R	Q5VWK5	629 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT80	Q6KB66	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf64	Q86WR6	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N2B8	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FADS6	Q8N9I5	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2M3	Q8NG83	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM10	Q96HG1	83 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TSG101	Q99816	390 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL31	Q9H511	634 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PDE10A	Q9Y233	779 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf51	A8MQB3	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCF5	A8MTL0	148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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