RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 IFT20Q8IY31 132 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 CDS1Q92903 461 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 STACQ99469 402 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 PIGUQ9H490 435 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 NGBQ9NPG2 151 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 LIPT1Q9Y234 373 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.09■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ZNF814B7Z6K7 855 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 NEFHP12036 1026 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 BCKDHAP12694 445 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 MLC1Q15049 377 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 P2RY6Q15077 328 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 PGGHGQ32M88 737 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 LIPMQ5VYY2 423 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ZNF524Q96C55 264 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 MTERF3Q96E29 417 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 GIN1Q9NXP7 522 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.08■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 DPRXA6NFQ7 191 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GJE1A6NN92 205 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NUDT14O95848 222 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NPIPA8P0DM63 369 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ENPP1P22413 925 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ACVR1BP36896 505 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 P2RX1P51575 399 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 BSPH1Q075Z2 132 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ITGADQ13349 1161 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 BANPQ8N9N5 519 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CCDC63Q8NA47 563 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GPR119Q8TDV5 335 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 TRIM2Q9C040 744 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 IGHV4-39P01824 125 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ATP6V1C1P21283 382 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ASMTP46597 345 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GALNTL6Q49A17 601 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 KANK2Q63ZY3 851 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CDC73Q6P1J9 531 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 TDRPQ86YL5 185 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 SLC43A2Q8N370 569 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ZNF527Q8NB42 609 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.06■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 A0A1W2PP18 115 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NDUFS7O75251 213 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CD8AP01732 235 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 PRKCAP17252 672 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 FAPQ12884 760 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 Q6ZT83 130 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 ZFP90Q8TF47 636 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 BCO1Q9HAY6 547 aa20.05■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CUBNO60494 3623 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 H3BNH8 94 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 RAMP1O60894 148 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 CHEK2O96017 543 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 SHBGP04278 402 aa20.04■□□□□ 0.8
USP4-208ENST00000464168 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms